תוואי הנחל מהמעלה מזרחית לישוב כרמי יוסף זורם בשטחים חקלאיים עד לבית חשמונאי משם ממשיך במקביל לכביש 424 עד מחלף נשרים, בהמשך חוצה את מחלף נשרים, מפעל נשר ממשיך וזורם בין אחיסמך ללוד ועד לחיבור עם נחל איילון בק"מ 26.6 שלו, בסמוך לכביש 40 בין לוד לבן שמן. הקרקעות האופייניות לאגן הם קרקעות סיין חרסיתיות במעלה ובמורד טרה רוסה חומה וגרומוסול חום אלובי.
