אגן נחל הדר מנקז את שטחי הוד השרון ורמות השבים. תוואי הנחל משטחי הוד השרון ועד להתמזגות עם נחל ירקון בק"מ 19.3 של הנחל, מזרחית למפגש נחלים ירקון-שילה.
במורד הנחל בוצע בשנים האחרונות שיקום ופיתוח הנחל ופארק עירוני הכולל בריכות אגנים ירוקים ואגם נופש המוזנים ממי קולחין. מורד האגן מאופיין בשטח פתוח/חקלאי.